تتكون أقسام المعهد من الآتي :-

1-    قسم الدراسات البيئية والنازحين واللاجئين، ويتكون من تخصصين:

·        الدراسات البيئية والتنمية.

·        دراسات النازحين واللاجئين.

2-    قسم العمل التطوعي والسلام، ويتكون من تخصصين:

·        دراسات إدارة المنظمات والعمل التطوعي.

·        دراسات السلام وحقوق الإنسان.

3-    قسم دراسات العون والأمن الإنساني، ويتكون من تخصص واحد:

·        دراسات العون والأمن الإنساني.